MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE05

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016806	ATA	2	6	28	33	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016806	CAT	2	6	139	144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016806	TCA	2	6	254	259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016806	GTG	2	6	282	287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016806	ATT	2	6	310	315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016806	CCAAT	2	10	336	345	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_016806	CTT	2	6	358	363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016806	TGT	2	6	394	399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016806	TCA	2	6	422	427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016806	CCA	2	6	431	436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_016806	CAT	2	6	459	464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016806	TTG	2	6	592	597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016806	CTC	2	6	613	618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_016806	TGGT	2	8	724	731	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016806	AAT	2	6	746	751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016806	TCA	3	9	761	769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016806	CTG	2	6	793	798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016806	TTC	2	6	839	844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016806	ATT	2	6	847	852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016806	TGT	2	6	939	944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016806	CAC	2	6	1023	1028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_016806	CAT	3	9	1173	1181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016806	TGT	2	6	1195	1200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016806	AC	3	6	1221	1226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016806	GTC	2	6	1228	1233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016806	T	6	6	1258	1263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016806	ATC	2	6	1264	1269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016806	TGC	2	6	1285	1290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016806	T	6	6	1306	1311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016806	ATC	2	6	1318	1323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016806	CTG	2	6	1332	1337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016806	GTC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016806	GTT	2	6	1358	1363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016806	ATC	2	6	1375	1380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016806	ATC	2	6	1399	1404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016806	GTT	2	6	1406	1411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016806	TAG	2	6	1434	1439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016806	CTGT	2	8	1442	1449	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_016806	TTA	2	6	1514	1519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016806	TGT	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016806	GTT	2	6	1556	1561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016806	GTT	2	6	1583	1588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016806	GTA	2	6	1589	1594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016806	ACTC	2	8	1621	1628	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016806	GCT	2	6	1640	1645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016806	TGC	2	6	1651	1656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016806	CTT	2	6	1690	1695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016806	ATT	2	6	1724	1729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016806	TCA	2	6	1762	1767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016806	GTT	2	6	1788	1793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016806	TTG	2	6	1813	1818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016806	TAAA	2	8	1832	1839	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016806	ATA	3	9	1847	1855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016806	AT	3	6	1859	1864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016806	TCAT	2	8	1869	1876	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016806	CTA	2	6	1913	1918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016806	CAAAA	2	10	1986	1995	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_016806	A	6	6	1997	2002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016806	CTT	2	6	2014	2019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381335652
60	NC_016806	GTAA	2	8	2024	2031	50 %	25 %	25 %	0 %	381335652
61	NC_016806	CAT	2	6	2039	2044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335652
62	NC_016806	ATCT	2	8	2067	2074	25 %	50 %	0 %	25 %	381335652
63	NC_016806	CTT	2	6	2118	2123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381335652
64	NC_016806	TAA	2	6	2191	2196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335652
65	NC_016806	ACC	2	6	2238	2243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	381335652
66	NC_016806	TAA	2	6	2446	2451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335652
67	NC_016806	GTA	2	6	2460	2465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335652
68	NC_016806	ACC	2	6	2508	2513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	381335652
69	NC_016806	ATG	2	6	2528	2533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335652
70	NC_016806	AAT	2	6	2610	2615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335652
71	NC_016806	CT	3	6	2686	2691	0 %	50 %	0 %	50 %	381335652
72	NC_016806	GAA	2	6	2709	2714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381335652
73	NC_016806	TAA	2	6	2716	2721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335652
74	NC_016806	GTAA	2	8	2801	2808	50 %	25 %	25 %	0 %	381335652
75	NC_016806	CGT	2	6	2900	2905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335652
76	NC_016806	AGT	2	6	2981	2986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335652
77	NC_016806	CAC	2	6	3011	3016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	381335652
78	NC_016806	AAT	2	6	3041	3046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335652
79	NC_016806	TTA	2	6	3106	3111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335652
80	NC_016806	CCAA	2	8	3117	3124	50 %	0 %	0 %	50 %	381335652
81	NC_016806	TGT	2	6	3234	3239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335652
82	NC_016806	ATG	2	6	3269	3274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335652
83	NC_016806	ATG	2	6	3329	3334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335652
84	NC_016806	AAC	2	6	3340	3345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335652

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.